Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms