Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPC6

Probable isocitrate dehydrogenase [NAD] gamma 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BPC6 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BPC6 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q8BPC6 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q8BPC6 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Q8BPC6 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q8BPC6 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q8BPC6 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q8BPC6 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms