Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Usp1Q8BJQ2 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
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Usp1Q8BJQ2 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Usp1Q8BJQ2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Usp1Q8BJQ2 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Usp1Q8BJQ2 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Usp1Q8BJQ2 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Usp1Q8BJQ2 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms