Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms