Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms