Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFX1

Rnf187, E3 ubiquitin-protein ligase RNF187, mousemouse

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Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf187Q8BFX1 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Rnf187Q8BFX1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Rnf187Q8BFX1 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Rnf187Q8BFX1 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Rnf187Q8BFX1 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Rnf187Q8BFX1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Rnf187Q8BFX1 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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Rnf187Q8BFX1 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Rnf187Q8BFX1 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf187Q8BFX1 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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