Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms