Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lrrc1Q80VQ1 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms