Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms