Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NischQ80TM9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
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