Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
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Dsg1bQ7TSF1 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Dsg1bQ7TSF1 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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