Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms