Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
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