Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms