Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms