Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S1

Atmin, ATM interactor, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtminQ6P9S1 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AtminQ6P9S1 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
AtminQ6P9S1 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
AtminQ6P9S1 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AtminQ6P9S1 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AtminQ6P9S1 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AtminQ6P9S1 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AtminQ6P9S1 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AtminQ6P9S1 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
AtminQ6P9S1 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AtminQ6P9S1 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AtminQ6P9S1 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AtminQ6P9S1 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AtminQ6P9S1 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AtminQ6P9S1 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
AtminQ6P9S1 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
AtminQ6P9S1 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
AtminQ6P9S1 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
AtminQ6P9S1 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AtminQ6P9S1 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AtminQ6P9S1 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
AtminQ6P9S1 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
AtminQ6P9S1 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
AtminQ6P9S1 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
AtminQ6P9S1 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AtminQ6P9S1 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
AtminQ6P9S1 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
AtminQ6P9S1 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AtminQ6P9S1 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AtminQ6P9S1 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AtminQ6P9S1 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms