Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6DFW0 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6DFW0 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q6DFW0 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q6DFW0 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q6DFW0 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q6DFW0 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q6DFW0 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Q6DFW0 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Q6DFW0 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.3 ms