Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fgd6Q69ZL1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fgd6Q69ZL1 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fgd6Q69ZL1 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Fgd6Q69ZL1 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fgd6Q69ZL1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fgd6Q69ZL1 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Fgd6Q69ZL1 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fgd6Q69ZL1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fgd6Q69ZL1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fgd6Q69ZL1 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fgd6Q69ZL1 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fgd6Q69ZL1 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fgd6Q69ZL1 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fgd6Q69ZL1 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fgd6Q69ZL1 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fgd6Q69ZL1 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fgd6Q69ZL1 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Fgd6Q69ZL1 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Fgd6Q69ZL1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fgd6Q69ZL1 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fgd6Q69ZL1 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fgd6Q69ZL1 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fgd6Q69ZL1 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fgd6Q69ZL1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fgd6Q69ZL1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fgd6Q69ZL1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fgd6Q69ZL1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fgd6Q69ZL1 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fgd6Q69ZL1 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fgd6Q69ZL1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fgd6Q69ZL1 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fgd6Q69ZL1 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fgd6Q69ZL1 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fgd6Q69ZL1 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fgd6Q69ZL1 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fgd6Q69ZL1 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fgd6Q69ZL1 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fgd6Q69ZL1 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms