Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ric1Q69ZJ7 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms