Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms