Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms