Protein–RNA interactions for Protein: Q61789

Lama3, Laminin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 3,330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama3Q61789 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lama3Q61789 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lama3Q61789 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lama3Q61789 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lama3Q61789 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lama3Q61789 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lama3Q61789 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Lama3Q61789 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lama3Q61789 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lama3Q61789 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lama3Q61789 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Lama3Q61789 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Lama3Q61789 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Lama3Q61789 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lama3Q61789 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lama3Q61789 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lama3Q61789 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lama3Q61789 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lama3Q61789 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lama3Q61789 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Lama3Q61789 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lama3Q61789 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Lama3Q61789 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Lama3Q61789 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Lama3Q61789 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lama3Q61789 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lama3Q61789 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lama3Q61789 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Lama3Q61789 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Lama3Q61789 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Lama3Q61789 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Lama3Q61789 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Lama3Q61789 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lama3Q61789 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Lama3Q61789 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lama3Q61789 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lama3Q61789 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lama3Q61789 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lama3Q61789 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lama3Q61789 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Lama3Q61789 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lama3Q61789 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lama3Q61789 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lama3Q61789 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lama3Q61789 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms