Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms