Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BcanQ61361 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BcanQ61361 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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BcanQ61361 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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BcanQ61361 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BcanQ61361 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BcanQ61361 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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BcanQ61361 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BcanQ61361 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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BcanQ61361 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BcanQ61361 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BcanQ61361 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BcanQ61361 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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BcanQ61361 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms