Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Cln3Q61124 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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Cln3Q61124 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Cln3Q61124 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Cln3Q61124 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Cln3Q61124 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Cln3Q61124 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Cln3Q61124 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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