Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms