Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprnQ60673 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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PtprnQ60673 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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PtprnQ60673 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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PtprnQ60673 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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PtprnQ60673 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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PtprnQ60673 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
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PtprnQ60673 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
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