Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nr2f1Q60632 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr2f1Q60632 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms