Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rnf123Q5XPI3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rnf123Q5XPI3 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rnf123Q5XPI3 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rnf123Q5XPI3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rnf123Q5XPI3 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rnf123Q5XPI3 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rnf123Q5XPI3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rnf123Q5XPI3 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rnf123Q5XPI3 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rnf123Q5XPI3 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Rnf123Q5XPI3 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Rnf123Q5XPI3 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Rnf123Q5XPI3 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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