Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Gm21118-202ENSMUST00000187418 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 AC131743.3-201ENSMUST00000222099 662 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Gm10925-201ENSMUST00000189941 678 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms