Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV77

Ggnbp2, Gametogenetin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp2Q5SV77 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ggnbp2Q5SV77 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms