Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPW0

Vps54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps54Q5SPW0 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vps54Q5SPW0 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vps54Q5SPW0 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vps54Q5SPW0 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vps54Q5SPW0 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vps54Q5SPW0 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vps54Q5SPW0 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vps54Q5SPW0 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vps54Q5SPW0 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vps54Q5SPW0 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vps54Q5SPW0 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vps54Q5SPW0 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vps54Q5SPW0 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vps54Q5SPW0 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vps54Q5SPW0 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vps54Q5SPW0 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vps54Q5SPW0 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vps54Q5SPW0 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vps54Q5SPW0 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vps54Q5SPW0 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vps54Q5SPW0 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Vps54Q5SPW0 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vps54Q5SPW0 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vps54Q5SPW0 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps54Q5SPW0 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms