Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rbm27Q5SFM8 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rbm27Q5SFM8 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rbm27Q5SFM8 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rbm27Q5SFM8 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rbm27Q5SFM8 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rbm27Q5SFM8 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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