Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
E2f8Q58FA4 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2f8Q58FA4 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2f8Q58FA4 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2f8Q58FA4 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms