Protein–RNA interactions for Protein: Q4VBF2

R3hdm4, R3H domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm4Q4VBF2 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
R3hdm4Q4VBF2 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms