Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox3aQ4TU90 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms