Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc3lQ4KL14 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms