Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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