Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Ppp1r2-ps9-202ENSMUST00000173852 882 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gm19585-201ENSMUST00000186007 587 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms