Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms