Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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