Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms