Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Cops9Q3U898 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Cops9Q3U898 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Cops9Q3U898 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Cops9Q3U898 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Cops9Q3U898 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Cops9Q3U898 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Cops9Q3U898 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Cops9Q3U898 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Cops9Q3U898 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Cops9Q3U898 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Cops9Q3U898 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Cops9Q3U898 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Cops9Q3U898 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Cops9Q3U898 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Cops9Q3U898 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Cops9Q3U898 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Cops9Q3U898 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Cops9Q3U898 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Cops9Q3U898 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Chd2-203ENSMUST00000169922 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Cops9Q3U898 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms