Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U595 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U595 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U595 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U595 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U595 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U595 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U595 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U595 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U595 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U595 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U595 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U595 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U595 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U595 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U595 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U595 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U595 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U595 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U595 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U595 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U595 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U595 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U595 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U595 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U595 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U595 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U595 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U595 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U595 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U595 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U595 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U595 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U595 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U595 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U595 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U595 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U595 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U595 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U595 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U595 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U595 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U595 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U595 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U595 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U595 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U595 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U595 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U595 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U595 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U595 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U595 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U595 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U595 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U595 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U595 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U595 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U595 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U595 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U595 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U595 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U595 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U595 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U595 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U595 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U595 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U595 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U595 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U595 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U595 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U595 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U595 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U595 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U595 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U595 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U595 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U595 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U595 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U595 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U595 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U595 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U595 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U595 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U595 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U595 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U595 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U595 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U595 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U595 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U595 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U595 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U595 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U595 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U595 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U595 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U595 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U595 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U595 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U595 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U595 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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