Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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