Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
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