Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ctdnep1Q3TP92 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ctdnep1Q3TP92 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ctdnep1Q3TP92 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ctdnep1Q3TP92 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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