Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBL6

Tnfaip8l3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l3Q3TBL6 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms