Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms