Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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Cers3Q1A3B0 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cers3Q1A3B0 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms